经济上结伙贪污,政治上很难秉公从事。九卿会推官员,亦不能至公至正,或草率苟且,或立议争胜,极力推荐自己意中人、亲朋、同乡、门生。官员间往往结成党援,互相包庇,徇私舞弊。康熙皇帝对督抚与部院堂官营求结纳,分立门户,处理政事不讲原则的弊端深恶痛绝。山西巡抚穆尔赛,贪酷已极,秽迹显著。当康熙皇帝向大学士、九卿等问其居官善否时,满大学士勒德洪等竟不据实陈奏,企图包庇。康熙二十四年(1685)二月,将勒德洪等各降二级,将满九卿科尔坤等各降三级,将穆尔赛拟以绞监候,秋后处决。康熙皇帝发现,“河工诸臣,一有冲决,但思获利,迟至数年,徒费钱粮,河上毫无裨益”,他认为根子在工部。他亲自主持,经数年清查,终于查实工部自尚书、侍郎以至分司官员,是一个大贪污集团。于是分别予以惩处。
康熙四十二年(1703)正月,康熙皇帝第四次南巡时,途经济南,出观趵突泉,书匾额“源清流洁”四字。此时,他的这一吏治指导思想完全成熟。
康熙皇帝将源清流洁思想用在吏治上,具有普遍意义。任何朝代,严格约束和考察高级官吏都是吏治第一要务。因为,他们身居要职,廉贪贤劣事关重大,首先,直接影响下级官吏。或者带出一批清廉贤能者;或养成一群庸劣无才、贪赃枉法之徒。其次,也关系甚至左右重大朝政,包括财政、人事、决策、立法等能否按正确轨道行事。从这个意义上说,康熙皇帝重点考察高级官吏的思想和某些措施,很值得后世借鉴。