航行一夜，南云舰队顺利驶入距中途岛400公里的攻击位置。浓雾已经消散，天际泛起彩霞，即将到来的6月4日，必定是个适于舰载机出航的好日子。4艘航空母舰上，108架第一波攻击飞机已经注满燃料，装好炸弹，拖出机库，比翼排列在甲板上。已穿好飞行服的飞行员们正在餐厅用餐，餐桌上摆满了干粟子、腌菜、豆酱汤、米饭，丰盛无比。间或有人举杯敬酒，预祝胜利。
南云还是不放心：仍然没有关于美国航空母舰的任何情报，这无论如何是一块心病。思虑半日，南云方心生一计，下令各舰派几架搜索机，在舰队以东500公里范围可能埋伏美军舰队的海域，作严密的扇面搜索，寻找敌航空母舰。4点30分，搜索机相继升空，只有负责扇面中央海域搜索的两架巡洋舰载水上飞机因弹射器故障，推迟30分钟起飞。南云闻报，长叹了一口气，回头传令攻击中途岛的第一波飞机升空。
随着南云令旗从“赤城号”主桅杆上升起，各舰一齐转向，迎风急驶。飞行甲板在强光探照光照耀下，明亮如昼。飞行员们一齐登上飞机，启动马达。轰鸣声中，战机滑向甲板，跃上高空。15分钟内，72架轰炸机和36架护航的零式战斗机全部升空。机群绕舰队飞行一圈，编好队形，一头往东南方向飞去。伫立在舰桥上的南云中将，观看了飞机升空的全过程，脸上露出了难得一见的笑意。眼见第一波飞机消失在海天相接处，他方回头，发出了第三号指令：第二波108架飞机提出机库，送上甲板，装好鱼雷和对舰攻击穿甲炸弹，准备攻击美国航空母舰。他并不知道，一架来自中途岛的美国侦察机已经盯上了他的舰队。另一架美国飞机，正悄悄跟在第一波日本攻击机群的后尾，一起飞向中途岛。南云现在正如一位闯进迷阵的武林高手，面临危局，步步是险，随时要应付各种莫测高深的挑战，一步出错，必将万劫不复。